Идея создания учебно-боевой машины на базе палубного истребителя МиГ-29К возникла одновременно со строительством первого экземпляра миговского палубника. Первоначально для подготовки пилотов МиГ-29К прорабатывался проект двухместной палубной учебно-боевой машины, получившей название МиГ-29КУ. Изучение возможностей использования сухопутного учебно-боевого самолета МиГ-29УБ для тренировки морских летчиков показало, что обзор из задней кабины инструктора явно недостаточен для обеспечения безопасной посадки на палубу. Поэтому кабины инструктора и обучаемого на МиГ-29КУ выполнили раздельными. Кресло в задней кабине установили с большим превышением относительно переднего, за счет чего на посадке из обеих кабин обеспечивался практически одинаковый обзор. Новое расположение кабин экипажа привело к изменению конструкции и обводов носовой части корпуса самолета. В связи с приостановлением работ по корабельному истребителю МиГ-29К рабочее проектирование его учебного варианта не проводилось. Были лишь построены продувочная модель МиГ-29КУ и полноразмерный макет головной части его корпуса.

В январе 2004 года был подписан контракт на поставку ВМС Индии многофункциональных истребителей корабельного базирования, который включал 12 одноместных самолетов МиГ-29К и 4 двухместных МиГ-29КУБ, а также обучение летчиков и технического персонала заказчика, поставку тренажеров, запчастей и организацию сервисного обслуживания самолетов. Одноместный МиГ-29К, многофункциональный истребитель корабельного базирования, предназначен для решения задач ПВО корабельных соединений, завоевания господства в воздухе, поражения надводных и наземных целей управляемым высокоточным и обычным оружием днем и ночью в любых погодных условиях. Его учебно-боевой вариант МиГ-29КУБ предназначен для тренировки навыков пилотирования и самолётовождения, отработки элементов боевого применения и решения боевых задач.

При создании планера, силовой установки и бортового оборудования МиГ-29КУБ использованы самые современные технологии. Доля композиционных материалов в составе планера достигла 15%. Самолет оснащается новыми двигателями РД-33МК с увеличенными тягой и ресурсом.

Бортовое радиолокационное оборудование самолета построено по принципу открытой архитектуры, что облегчает модернизацию самолета и наращивание его арсенала. На МиГ-29КУБ устанавливаются современные многофункциональные импульсно-доплеровские радиолокационные станции "Жук-МЭ" и новейшие оптико-электронные системы.

Первый полет истребителя МиГ-29КУБ состоялся в январе 2007 года.