Задача создания барражирующего истребителя-перехватчика в связи с острой необходимостью защиты рубежей на Крайнем Севере и Дальне Востоке была поставлена еще в 1948 году, но только три года спустя вышло соответствующее постановление правительства. В июне 1952 года состоялся первый полет двухместного двухдвигательного барражирующего истребителя-перехватчика Як-120.

Як-120 существенно отличался от перехватчиков других ОКБ. Самолет проектировали под мощный радиолокационный прицел РП-6 "Сокол" с расчетной дальностью обнаружения целей около 30км. Это определило компоновку с двумя двигателями на крыле, освободившими всю носовую часть фюзеляжа под большую, диаметром свыше метра, антенну. Однако выпуск "Сокола" сильно запаздывал и вместо него пришлось установить менее мощный РП-1 "Изумруд". По компоновочным соображениям решили применить велосипедную схему шасси. Под фюзеляжем между нишами основных опор шасси предусматривалась подвеска дополнительного топливного бака.

Кресла пилотов в герметичной кабине установили тандемом под общей сдвигавшейся назад крышкой фонаря. Экипаж самолета был защищен лобовым бронестеклом и бронеплитами. Крыло с постоянной хордой имело стреловидность 45°. Стабилизатор был поднят и крепился на половине размаха киля. Вооружение состояло из двух 37-мм пушек Н-37Л, которые устанавливались в нижней части фюзеляжа.

Заводские испытания проводил летчик-испытатель Волков. Самолет оказался меньше по размерам и легче перехватчика "200Б" Лавочкина. Благодаря новым малогабаритным двигателям АМ-5 и хорошей аэродинамике на Як-120 удалось получить более высокие летные характеристики. Самолет имел хорошую управляемость и допускал выполнение фигур сложного пилотажа.

Несмотря на ряд замечаний госкомиссии, было принято решение о запуске самолета после доработок в серию под обозначением Як-25.

После завершения первого этапа госиспытаний второй опытный экземпляр доработали под более мощные двигатели АМ-9А, которые имели форсажный режим. Кроме того, новый перехватчик, получивший обозначение Як-120М, должен был оснащаться контейнерами для неуправляемых реактивных снарядов и доработанной станцией "Сокол-М". Однако в связи с задержкой поставки двигателей постройка опытного самолета завершилась лишь в конце 1954 года. Гондолы двигателей увеличили по длине и сечению. В нижней части фюзеляжа сделали две ниши под контейнеры снарядов АРС-57, изменили форму и объем топливных баков. Для снижения массы вместо 37-мм установили пушки калибра 23мм. Довести станцию "Сокол-М" разработчикам так и не удалось, поэтому Як-120М в серию запускать не стали.

В 1955 году начался выпуск перехватчиков Як-25М со станцией РП-6 "Сокол" и в этом варианте было поставлено большинство самолетов Як-25. Перехватчик был предназначен для работы по по низковысотным целям в любых погодных условиях, в любое время суток и на большом удалении от базы. Самолеты пользовались неплохой репутацией у летных и наземных экипажей. Освоение нового перехватчика строевыми летчиками прошло достаточно легко. Во многом этому способствовало наличие на самолете второго полноценного управления, что решало характерную для советской авиации проблему учебной "спарки". Кроме того, дублированное управление значительно облегчало работу летчиков в длительном полете.

Основным недостатком самолета стала низкая подвеска двигателей, которые при движении по земле засасывали в воздухозаборники мусор с бетонки. Это приводило к отказам двигателей, особенно опасным на взлете. Безопасное покидание самолета обеспечивалось в высоты не менее 500м.

С появлением управляемого ракетного вооружения все истребительные КБ получили задание оборудовать образцы своих изделий для оценки их в качестве носителей ракет. В 1955 году на доработанном Як-25М прошла испытания система вооружения К-5, включавшая ракеты РС-1У и РЛС "Изумруд". Между фюзеляжем и гондолами двигателей установили по два пусковых устройства, сняли пушечное вооружение и разместили необходимое дополнительное оборудование. После испытаний систему К-5 приняли на вооружение, а самолет запустили в ограниченную серию под обозначением Як-25К. Дальность обнаружения цели составляла около 7км, а уверенный захват происходил на расстоянии порядка 4км. На самолетах Як-25 проводились испытания и других ракетных комплексов, но принимать их на вооружение не стали.

Вполне современный для середины пятидесятых годов Як-25 устаревал очень быстро, но замены им не было и самолеты оставались в полках до 1967 года. Всего было выпущено 480 самолетов этого типа.