В составе первой партии из 50 экземпляров самолета Mosquito двадцать машин должны были быть выпущенными в варианте разведчика PR.I. Двухместный разведчик имел две кабины. Впереди размещался навигатор, а летчика для улучшения обзора разместили над передней кромкой крыла. Помимо наличия фотоаппаратов, разведчики отличались от бомбардировщиков удлиненным на 508мм крылом. Первые двадцать разведчиков имели короткие, не выступавшие за заднюю кромку крыла мотогондолы.

В июне 1941 года разведчик совершил свой первый полет. С двумя моторами Merlin 21 самолет развил скорость 618км/ч. Летом 1941 года эта машина по скорости во всем диапазоне высот превосходила новейший германский истребитель Bf.109F. Английские ВВС получили великолепный разведчик, на долгие годы ставший проблемой для ПВО Германии.

Острая нехватка разведчиков привела к переделке части бомбардировщиков в разведывательный вариант PR.IV. В октябре 1942 года взлетел первый из пяти PR.VIII, оснащенный высотными моторами Merlin 61 с двухступенчатыми нагнетателями.

Разведчик PR.IX оснастили двигателями Merlin 72, а увеличенный запас топлива обеспечивал дальность полета почти до 4000км. К этому времени американцы разработали и передали британскому союзнику авиабомбу для ночной аэрофотосъемки М-46, что позволило производить аэрофотосъемку ночью с больших высот.

В ноябре 1943 года началось серийное производство наиболее массового варианта разведчика PR.XVI. Силовая установка осталась без изменений, как на B.IX, зато кабину выполнили герметичной, что должно было значительно улучшить условия работы экипажа на больших высотах. В одном из вылетов машина поднялась на высоту более 12000м. Машина строилась серийно вплоть до конца войны. Всего было выпущено 435 самолетов этого типа.

Осенью 1944 года фирма построила пять разведчиков PR.32, отличавшихся увеличенным до 18м размахом крыла. Силовая установка включала два новейших мотора Merlin 113. Самолет максимально облегчили для полетов на высотах более 12000м. Ожидалось, что такой самолет не смогут достать реактивные и ракетные истребители немцев. Однако надежды не оправдались: зимой 1944 года немецкие перехватчики патрулировали над Берлином на высоте до 12600м.

Последняя серийная модификация PR.34 с моторами Merlin 114 предназначалась для сверхдальних полетов. Огромный бензобак в выступающем отсеке фюзеляжа и два сбрасываемых подкрыльевых бака обеспечили дальность полета до 5750км. Полностью заправленная машина весила 11580кг и чтобы обеспечить рабочий потолок PR.34, пришлось отказаться от брони и протектирования баков.

Из самолетов, собранных в Австралии, шесть были переоборудовали в фоторазведчики PR.40. В отличие от английских разведчиков у австралийских самолетов носовая часть фюзеляжа оставалась незастекленной и использовалась для размещения двух фотокамер.

В июле 1944 года Mosquito начались перехваты разведчиков реактивными истребителями Ме-262. Высокие скоростные качества самолета уже не могли помочь - немецкие самолеты были значительно быстроходнее. Выручала отличная маневренность.

Осенью 1944 года PR.32 привлекли к участию в высотных беспосадочным перелетам из Великобритании в Советский Союз для доставки дипломатической почты.

В составе американских ВВС эксплуатировались преимущественно разведывательные варианты Mosquito. Они заметно превосходили по дальности полета и потолку разведчик F-5 Lightning. Машины слегка переоборудовали, установив американские приборы, радиостанцию и радиовысотомер.