После неудачи с самолетом Rs.I компания Zeppelin-Lindau начала постройку новой цельнометаллической летающей лодки Rs.IIa. Руководил постройкой инженер Claude Dornier. Наиболее важным изменением являлся широкий корпус, который стал первым шагом к характерной для Dornier практичной и устойчивой конструкции корпуса. Другие изменения включали широкое верхнее крыло малого удлинения, открытую структуру хвостовой балки и хвостовое оперение сложной коробчатой конструкции. От Rs.I новая летающая лодка унаследовала механизм изменения угла установки верхнего крыла и полотняную обшивку крыльев. Нижнее крыло небольшого размаха не связывалось стойками с верхним крылом. Изначально оно предназначалось для установки поддерживающих поплавков, но лодка оказалась достаточно устойчивой и без таких поплавков.

Все три двигателя Maybach IVa мощностью 245л.с. были размещены в фюзеляже, а толкающие винты приводились в движение через систему удлиненных валов и зубчатых передач. Радиаторы двигателей были установлены в виде широкой плиты в верхней части корпуса позади кабины пилотов. Экипаж размещался в носовой части в большой открытой кабине.

Первый полет летающей лодки Rs.IIa состоялся в июне 1916 года. В ходе испытаний постепенно пришлось отказаться и от чрезмерно усложненного оперения, и от размещения моторов внутри лодки. Перестроенный Rs.IIb был практически новым самолетом. Двигатели, которых стало четыре, установили под верхним крылом. Новое расположение двигателей потребовало изменения положения хвостового оперения, чтобы избежать зоны ометания винтов. Для улучшения маневренности на воде были установлены широкие киль и руль направления значительно увеличенной площади. Переработали корпус лодки, перенеся редан ближе к корме.

До лета 1917 года самолет выполнил большое количество полетов и постоянно дорабатывался. Летные характеристики были признаны вполне достаточными для дальних разведывательных полётов. Но старые ненадежные двигатели доставляли много хлопот и после очередной аварии самолет было решено списать.