В середине двадцатых годов объёмы пассажирских авиаперевозок устойчиво росли. В связи с этим Гуго Юнкерс решил создать авиалайнер больших размеров, чем Junkers G.24. Новый самолёт, разработка которого началась в 1925 году, получил название Junkers G.31 и был рассчитан на перевозку 15 пассажиров. Просторный пассажирский салон был разделён на 3 секции, на борту имелись туалеты. Постройка самолёта стала реальной после того как союзная Контрольная Комиссия ослабила запреты на создание больших самолётов в Германии.

Прототип Junkers G.31ba c двигателями Junkers L5 совершил первый полёт 13 сентября 1926 года. В целом испытания оправдали надежды конструкторов, но мощности двигателей оказалось маловато. Поэтому в носу пришлось поставить более мощный мотор BMW-VI. Самолет представлял собой цельнометаллический трёхмоторный низкоплан классической схемы с фюзеляжем прямоугольного сечения. Обшивка из тонкого гофрированного дюраля. Оперение - двухкилевое. На некоторых вариантах устанавливался двойной стабилизатор. Шасси двухстоечное с хвостовым костылем. Пилотская кабина на первых самолетах была открытой, потом ее стали делать закрытой.

Первым заказчиком нового лайнера стала компания Deutsche Luft Hansa. Поставки начались в июне 1927 года. Сначала на линии вышел вариант G.31ce с двигателями Gnôme Rhône Jupiter. На этом самолёте впервые у Deutsche Luft Hansa появились стюарды. Более совершенные G.31de немецкая авиакомпания приобрела в 1928 году. На них поставили второй (верхний) стабилизатор. В том же году появилась версия G.31fi с удлинённым фюзеляжем. На этих лайнерах были оборудованы бортовые кухни, что позволило подавать во время полёта горячие пищу и напитки.

В 1929 году был выпущен самолёт G.31fo с закрытой пилотской кабиной и более мощными двигателями BMW Hornet. Всего же в немецкую авиакомпанию поступили восемь G.31, которые обслуживали магистральные европейские ночные и дневные рейсы. К середине тридцатых годов Junkers G.31 перевели на внутренние линии. Несколько самолетов в пассажирской и грузовой модификации было поставлено на экспорт.

Junkers G.31 оказался неплохим транспортным самолётом, но в коммерческом плане его постигла неудача. Заказов было мало, построили всего 13 машин. Хотя G.24 имел меньшую вместимость и обеспечивал меньший комфорт, он не уступал G.31 в эффективности, а стоил на 40% дешевле.