Идея самолетов-тральщиков родилась в ответ на массированное применение Королевскими ВВС Великобритании неконтактных магнитных мин против Германии. Германским силам противоминной обороны требовался новый, высокопроизводительный тральщик, способный в сжатые сроки, неоднократно, с учетом возможного наличия у выставленных мин приборов кратности, обработать значительные площади. Теодор Бенеке, выпускник Кильского университета, проект оборудования транспортного самолета Ju.52 устройством, генерирующим магнитное поле такой силы, чтобы мины взрывались на безопасном расстоянии после пролета над ними.

Первый самолет-тральщик был оборудован в течение пяти недель. Сам трал представлял собой дюралевое кольцо диаметром 14,6 метра с 44 витками алюминиевой проволоки, крепившееся на подкосах под крылом и фюзеляжем. В качестве источника питания использовали 150-киловаттный генератор. Пробный вылет был совершен для уничтожения мин у входа в голландский порт Флиссинген. Система отработала нормально, мины взрывались в 200-300 метрах за кормой, на безопасном расстоянии для самолета, летящего на высоте всего 10-20 метров. Несмотря на солидных размеров трал, летные характеристики машины ухудшились незначительно.

Для поиска мин немцы использовали и другие самолеты, но именно Ju.52MS стал основным тральщиком. Всего в этот вариант было переоборудовано около 70 машин.

Появление у немцев такого средства борьбы с неконтактными минами как самолеты-тральщики Ju52MS, не ускользнуло от внимания англичан. Их ответом стало применение мин с двухканальным, индукционно-акустическим, взрывателем. Индукционная катушка магнитного взрывателя такой мины включалась дежурным акустическим каналом только после того, как шум создаваемый винтами корабля достигал определенного, порогового уровня.

Для траления магнитно-акустических мин в 1943 году была разработана система из двух самолетов Ju.52. Первым шел самолет, который сбрасывал подрывные заряды, которые взрываясь, создавали звуковые колебания, вызывающие срабатывание акустического канала мины. За ним на расстоянии 200-300 метров шел Ju.52MS с магнитным тралом.

Такая боевая работа не обходилась без потерь. Гарантии, что мина взорвется на безопасном расстоянии от самолета не было никакой. Тем не менее тральщики Ju.52MS с успехом применялись всю войну.